《仁醫2》完結篇延續前篇劇情歷史依舊向著既定方向有條不紊的前行更多耳熟能詳的歷史角色悉數登場南方仁（大澤隆夫 飾）以大夫的身份在江戶時代生存了下來所開設的醫館仁友堂亦步入正軌一天他得知橘咲（綾瀨遙 飾）的母親患了當時普遍的腳氣病由此決意制作并普及可治愈該病的點心與此同時坂本龍馬（內野圣陽 飾）出現在仁面前請求幫助仁隨龍馬來到京都救治勝海舟的師父佐久間象山竟從蘇醒的后者口中得知了驚人的往事……禁門之變后京都滿目瘡痍原本留下救人的仁被新撰組帶至薩摩藩救治西鄉隆盛此后坂本龍馬牽線西鄉隆盛與長州藩促成薩長同盟 　　親歷著幕末日本局勢的陡然巨變仁對自己之于這個時代意義有了嶄新的認識在不遠的未來他將重新邂逅尋找新生活的野風（中谷美紀 飾）前篇中圍繞在他們周身的謎團亦將逐一得到解答